Les Unités de Recherche du Centre sont regroupées au sein de trois départements :
- Un département de recherche clinique, principalement consacré aux essais cliniques et à la problématique des résistances des agents infectieux aux médicaments ;
- Un département de recherche plus fondamentale qui a pour objectifs la caractérisation des microorganismes, l’investigation des modalités de circulation des agents infectieux dans la nature et l’exploration des mécanismes d’émergence des agents infectieux chez l’Homme et de l’apparition des épidémies ;
- Un département de primatologie.
Le Département de Recherche Médicale
- Laboratoire d’Analyses Médicales / Bactériologie / Hygiène et Sécurité
- Parasitologie médicale et diversité plasmodiale
- Biodiversité, Ecologie et Evolution des Parasites
- Parasitoses négligées
- Ecologie des Systèmes Vectoriels
Le Département Zoonoses et Maladies Émergentes
- Syndromes cliniques et virus associés
- Zoonoses virales / Pathologies de la Faune et des animaux domestiques
- Rétrovirus animaux
Le Département de Primatologie
Les Unités Mixtes de Recherche (UMR)
- UMR BIOMED
- UMR VIH-MIA